Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frat1P70339 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frat1P70339 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frat1P70339 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Frat1P70339 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frat1P70339 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frat1P70339 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frat1P70339 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frat1P70339 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frat1P70339 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frat1P70339 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frat1P70339 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frat1P70339 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frat1P70339 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frat1P70339 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frat1P70339 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frat1P70339 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frat1P70339 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Frat1P70339 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frat1P70339 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frat1P70339 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frat1P70339 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frat1P70339 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frat1P70339 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frat1P70339 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Frat1P70339 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frat1P70339 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frat1P70339 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frat1P70339 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frat1P70339 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Frat1P70339 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frat1P70339 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Frat1P70339 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frat1P70339 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frat1P70339 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frat1P70339 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Frat1P70339 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frat1P70339 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frat1P70339 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms