Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkacbP68181 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkacbP68181 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkacbP68181 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkacbP68181 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkacbP68181 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkacbP68181 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkacbP68181 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrkacbP68181 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkacbP68181 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkacbP68181 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkacbP68181 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkacbP68181 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkacbP68181 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkacbP68181 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkacbP68181 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms