Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actg2P63268 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actg2P63268 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actg2P63268 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actg2P63268 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actg2P63268 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actg2P63268 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actg2P63268 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actg2P63268 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actg2P63268 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actg2P63268 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actg2P63268 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actg2P63268 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actg2P63268 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actg2P63268 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actg2P63268 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actg2P63268 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actg2P63268 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actg2P63268 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actg2P63268 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actg2P63268 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actg2P63268 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actg2P63268 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actg2P63268 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actg2P63268 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 793.4 ms