Protein–RNA interactions for Protein: P63133

ERVK-8, Endogenous retrovirus group K member 8 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-8P63133 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVK-8P63133 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERVK-8P63133 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVK-8P63133 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERVK-8P63133 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-8P63133 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-8P63133 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-8P63133 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVK-8P63133 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-8P63133 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVK-8P63133 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-8P63133 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-8P63133 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERVK-8P63133 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-8P63133 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-8P63133 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-8P63133 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-8P63133 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms