Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNB1P62873 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNB1P62873 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNB1P62873 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNB1P62873 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNB1P62873 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GNB1P62873 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNB1P62873 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GNB1P62873 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GNB1P62873 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNB1P62873 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNB1P62873 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GNB1P62873 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GNB1P62873 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNB1P62873 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GNB1P62873 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNB1P62873 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GNB1P62873 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNB1P62873 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GNB1P62873 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNB1P62873 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GNB1P62873 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNB1P62873 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GNB1P62873 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GNB1P62873 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB1P62873 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB1P62873 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB1P62873 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB1P62873 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GNB1P62873 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB1P62873 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB1P62873 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GNB1P62873 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB1P62873 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB1P62873 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GNB1P62873 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNB1P62873 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GNB1P62873 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB1P62873 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GNB1P62873 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB1P62873 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB1P62873 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GNB1P62873 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNB1P62873 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GNB1P62873 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GNB1P62873 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNB1P62873 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNB1P62873 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNB1P62873 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNB1P62873 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNB1P62873 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNB1P62873 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB1P62873 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB1P62873 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNB1P62873 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNB1P62873 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNB1P62873 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNB1P62873 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB1P62873 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNB1P62873 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNB1P62873 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB1P62873 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB1P62873 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GNB1P62873 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GNB1P62873 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GNB1P62873 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GNB1P62873 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GNB1P62873 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB1P62873 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB1P62873 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNB1P62873 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB1P62873 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB1P62873 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB1P62873 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB1P62873 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNB1P62873 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB1P62873 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB1P62873 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNB1P62873 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNB1P62873 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB1P62873 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GNB1P62873 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB1P62873 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB1P62873 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GNB1P62873 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GNB1P62873 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GNB1P62873 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB1P62873 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNB1P62873 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNB1P62873 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNB1P62873 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNB1P62873 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNB1P62873 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNB1P62873 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNB1P62873 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms