Protein–RNA interactions for Protein: P62835

Rap1a, Ras-related protein Rap-1A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1aP62835 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rap1aP62835 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rap1aP62835 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rap1aP62835 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rap1aP62835 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rap1aP62835 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rap1aP62835 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rap1aP62835 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rap1aP62835 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rap1aP62835 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rap1aP62835 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rap1aP62835 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rap1aP62835 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rap1aP62835 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rap1aP62835 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rap1aP62835 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rap1aP62835 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rap1aP62835 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rap1aP62835 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rap1aP62835 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rap1aP62835 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms