Protein–RNA interactions for Protein: P62508

ESRRG, Estrogen-related receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRGP62508 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ESRRGP62508 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ESRRGP62508 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ESRRGP62508 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ESRRGP62508 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESRRGP62508 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESRRGP62508 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESRRGP62508 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESRRGP62508 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESRRGP62508 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ESRRGP62508 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ESRRGP62508 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ESRRGP62508 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESRRGP62508 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESRRGP62508 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESRRGP62508 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRGP62508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESRRGP62508 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms