Protein–RNA interactions for Protein: P62488

Polr2g, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2gP62488 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2gP62488 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2gP62488 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2gP62488 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Polr2gP62488 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2gP62488 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2gP62488 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2gP62488 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr2gP62488 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr2gP62488 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr2gP62488 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Polr2gP62488 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr2gP62488 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr2gP62488 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr2gP62488 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr2gP62488 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr2gP62488 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr2gP62488 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr2gP62488 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr2gP62488 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms