Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vbp1P61759 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vbp1P61759 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vbp1P61759 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vbp1P61759 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vbp1P61759 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vbp1P61759 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vbp1P61759 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vbp1P61759 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vbp1P61759 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vbp1P61759 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vbp1P61759 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vbp1P61759 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vbp1P61759 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vbp1P61759 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vbp1P61759 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vbp1P61759 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vbp1P61759 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vbp1P61759 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vbp1P61759 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vbp1P61759 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vbp1P61759 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms