Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RND3P61587 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RND3P61587 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RND3P61587 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RND3P61587 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RND3P61587 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RND3P61587 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RND3P61587 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RND3P61587 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RND3P61587 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RND3P61587 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RND3P61587 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RND3P61587 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RND3P61587 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RND3P61587 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RND3P61587 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RND3P61587 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RND3P61587 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RND3P61587 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RND3P61587 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RND3P61587 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RND3P61587 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RND3P61587 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RND3P61587 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RND3P61587 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND3P61587 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND3P61587 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND3P61587 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND3P61587 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RND3P61587 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RND3P61587 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RND3P61587 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RND3P61587 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RND3P61587 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RND3P61587 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RND3P61587 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RND3P61587 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RND3P61587 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RND3P61587 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RND3P61587 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RND3P61587 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RND3P61587 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RND3P61587 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RND3P61587 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RND3P61587 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RND3P61587 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RND3P61587 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RND3P61587 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RND3P61587 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RND3P61587 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RND3P61587 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RND3P61587 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RND3P61587 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RND3P61587 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RND3P61587 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RND3P61587 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RND3P61587 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RND3P61587 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RND3P61587 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RND3P61587 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RND3P61587 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RND3P61587 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RND3P61587 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RND3P61587 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RND3P61587 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RND3P61587 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RND3P61587 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RND3P61587 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RND3P61587 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RND3P61587 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RND3P61587 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RND3P61587 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RND3P61587 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RND3P61587 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RND3P61587 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RND3P61587 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RND3P61587 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RND3P61587 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RND3P61587 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RND3P61587 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RND3P61587 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RND3P61587 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RND3P61587 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RND3P61587 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RND3P61587 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RND3P61587 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RND3P61587 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RND3P61587 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RND3P61587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RND3P61587 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RND3P61587 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RND3P61587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RND3P61587 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RND3P61587 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RND3P61587 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RND3P61587 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RND3P61587 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RND3P61587 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RND3P61587 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RND3P61587 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms