Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL27P61353 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL27P61353 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL27P61353 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL27P61353 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL27P61353 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL27P61353 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL27P61353 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL27P61353 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL27P61353 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL27P61353 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL27P61353 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL27P61353 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL27P61353 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL27P61353 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL27P61353 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL27P61353 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL27P61353 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL27P61353 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL27P61353 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL27P61353 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL27P61353 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL27P61353 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL27P61353 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL27P61353 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL27P61353 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL27P61353 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL27P61353 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL27P61353 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL27P61353 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL27P61353 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL27P61353 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL27P61353 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL27P61353 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL27P61353 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL27P61353 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL27P61353 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL27P61353 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL27P61353 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL27P61353 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL27P61353 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL27P61353 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL27P61353 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL27P61353 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL27P61353 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL27P61353 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPL27P61353 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPL27P61353 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL27P61353 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL27P61353 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPL27P61353 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPL27P61353 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPL27P61353 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL27P61353 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL27P61353 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL27P61353 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL27P61353 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL27P61353 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL27P61353 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL27P61353 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL27P61353 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL27P61353 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL27P61353 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL27P61353 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL27P61353 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL27P61353 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL27P61353 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL27P61353 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL27P61353 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL27P61353 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL27P61353 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL27P61353 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL27P61353 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL27P61353 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL27P61353 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL27P61353 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL27P61353 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL27P61353 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL27P61353 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL27P61353 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL27P61353 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL27P61353 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL27P61353 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL27P61353 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL27P61353 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL27P61353 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL27P61353 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL27P61353 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL27P61353 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL27P61353 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL27P61353 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL27P61353 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL27P61353 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL27P61353 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms