Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR4P61073 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCR4P61073 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CXCR4P61073 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CXCR4P61073 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCR4P61073 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCR4P61073 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCR4P61073 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR4P61073 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR4P61073 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR4P61073 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms