Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABARAPL2P60520 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABARAPL2P60520 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABARAPL2P60520 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABARAPL2P60520 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABARAPL2P60520 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABARAPL2P60520 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABARAPL2P60520 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABARAPL2P60520 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABARAPL2P60520 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GABARAPL2P60520 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABARAPL2P60520 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABARAPL2P60520 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABARAPL2P60520 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABARAPL2P60520 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABARAPL2P60520 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABARAPL2P60520 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms