Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dpf3P58269 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dpf3P58269 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Dpf3P58269 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dpf3P58269 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dpf3P58269 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Dpf3P58269 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dpf3P58269 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dpf3P58269 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dpf3P58269 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Dpf3P58269 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dpf3P58269 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Dpf3P58269 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dpf3P58269 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dpf3P58269 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Dpf3P58269 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Dpf3P58269 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dpf3P58269 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dpf3P58269 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dpf3P58269 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Dpf3P58269 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Dpf3P58269 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Dpf3P58269 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dpf3P58269 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dpf3P58269 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dpf3P58269 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dpf3P58269 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dpf3P58269 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dpf3P58269 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dpf3P58269 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dpf3P58269 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Dpf3P58269 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Dpf3P58269 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Dpf3P58269 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf3P58269 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Dpf3P58269 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dpf3P58269 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Dpf3P58269 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dpf3P58269 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dpf3P58269 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dpf3P58269 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Dpf3P58269 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dpf3P58269 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dpf3P58269 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dpf3P58269 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dpf3P58269 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dpf3P58269 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Dpf3P58269 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dpf3P58269 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dpf3P58269 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms