Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRG3P56975 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRG3P56975 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRG3P56975 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NRG3P56975 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRG3P56975 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRG3P56975 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRG3P56975 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRG3P56975 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRG3P56975 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRG3P56975 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NRG3P56975 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRG3P56975 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRG3P56975 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRG3P56975 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRG3P56975 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRG3P56975 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRG3P56975 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRG3P56975 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRG3P56975 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRG3P56975 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRG3P56975 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRG3P56975 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRG3P56975 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRG3P56975 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRG3P56975 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRG3P56975 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRG3P56975 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRG3P56975 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG3P56975 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRG3P56975 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG3P56975 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG3P56975 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRG3P56975 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG3P56975 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG3P56975 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRG3P56975 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG3P56975 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRG3P56975 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG3P56975 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG3P56975 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NRG3P56975 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRG3P56975 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG3P56975 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG3P56975 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG3P56975 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRG3P56975 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG3P56975 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG3P56975 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG3P56975 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRG3P56975 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG3P56975 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG3P56975 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG3P56975 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG3P56975 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRG3P56975 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRG3P56975 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRG3P56975 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG3P56975 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG3P56975 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRG3P56975 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRG3P56975 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRG3P56975 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG3P56975 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG3P56975 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG3P56975 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG3P56975 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRG3P56975 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRG3P56975 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG3P56975 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG3P56975 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG3P56975 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG3P56975 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRG3P56975 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRG3P56975 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRG3P56975 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG3P56975 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRG3P56975 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRG3P56975 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG3P56975 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRG3P56975 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG3P56975 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRG3P56975 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG3P56975 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG3P56975 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG3P56975 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG3P56975 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRG3P56975 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRG3P56975 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRG3P56975 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRG3P56975 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG3P56975 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRG3P56975 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms