Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN18P56856 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN18P56856 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN18P56856 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN18P56856 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN18P56856 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN18P56856 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN18P56856 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN18P56856 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN18P56856 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN18P56856 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN18P56856 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN18P56856 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN18P56856 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN18P56856 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms