Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 SPT8YLR055C 1809 nt7.43□□□□□ -1.22 RIP-Chip
GIS2P53849 MSF1YPR047W 1410 nt7.43□□□□□ -1.22
GIS2P53849 ADH2YMR303C 1047 nt7.42□□□□□ -1.22
GIS2P53849 LYS4YDR234W 2082 nt7.42□□□□□ -1.22
GIS2P53849 YFL066CYFL066C 1179 nt7.39□□□□□ -1.23 RIP-Chip
GIS2P53849 AHT1YHR093W 549 nt7.39□□□□□ -1.23
GIS2P53849 BIO4YNR057C 714 nt7.37□□□□□ -1.23 RIP-Chip
GIS2P53849 WSC2YNL283C 1512 nt7.37□□□□□ -1.23
GIS2P53849 GLR1YPL091W 1452 nt7.36□□□□□ -1.23
GIS2P53849 THI74YDR438W 1113 nt7.36□□□□□ -1.23
GIS2P53849 RNQ1YCL028W 1218 nt7.35□□□□□ -1.23
GIS2P53849 MIR1YJR077C 936 nt7.32□□□□□ -1.24
GIS2P53849 AQY1YPR192W 918 nt7.32□□□□□ -1.24
GIS2P53849 YSP3YOR003W 1437 nt7.32□□□□□ -1.24
GIS2P53849 YNL115CYNL115C 1935 nt7.32□□□□□ -1.24
GIS2P53849 YIH1YCR059C 777 nt7.31□□□□□ -1.24
GIS2P53849 RBG2YGR173W 1107 nt7.31□□□□□ -1.24
GIS2P53849 YLR415CYLR415C 339 nt7.31□□□□□ -1.24
GIS2P53849 SWE1YJL187C 2460 nt7.3□□□□□ -1.24
GIS2P53849 BDH1YAL060W 1149 nt7.28□□□□□ -1.24
GIS2P53849 ERF2YLR246W 1080 nt7.28□□□□□ -1.24
GIS2P53849 VPS75YNL246W 795 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
GIS2P53849 YLL053CYLL053C 459 nt7.27□□□□□ -1.25
GIS2P53849 Q0182Q0182 405 nt7.26□□□□□ -1.25
GIS2P53849 BOR1YNL275W 1731 nt7.26□□□□□ -1.25
GIS2P53849 CRR1YLR213C 1269 nt7.25□□□□□ -1.25
GIS2P53849 DAT1YML113W 747 nt7.22□□□□□ -1.25
GIS2P53849 YJL225CYJL225C 5277 nt7.21□□□□□ -1.25 RIP-Chip
GIS2P53849 ATF2YGR177C 1608 nt7.21□□□□□ -1.26
GIS2P53849 YGL034CYGL034C 366 nt7.2□□□□□ -1.26
GIS2P53849 YMR226CYMR226C 804 nt7.2□□□□□ -1.26
GIS2P53849 HEM12YDR047W 1089 nt7.19□□□□□ -1.26
GIS2P53849 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt7.19□□□□□ -1.26
GIS2P53849 MIC10YCL057C-A 294 nt7.19□□□□□ -1.26
GIS2P53849 FTR1YER145C 1215 nt7.18□□□□□ -1.26
GIS2P53849 PAU7YAR020C 168 nt7.18□□□□□ -1.26
GIS2P53849 NDI1YML120C 1542 nt7.17□□□□□ -1.26
GIS2P53849 SNG1YGR197C 1644 nt7.17□□□□□ -1.26
GIS2P53849 YFL067WYFL067W 528 nt7.17□□□□□ -1.26 RIP-Chip
GIS2P53849 SAM1YLR180W 1149 nt7.17□□□□□ -1.26
GIS2P53849 TRM5YHR070W 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
GIS2P53849 GAL1YBR020W 1587 nt7.16□□□□□ -1.26
GIS2P53849 RDN37-1RDN37-1 5354 nt7.16□□□□□ -1.26
GIS2P53849 RDN37-2RDN37-2 5354 nt7.16□□□□□ -1.26
GIS2P53849 SPC25YER018C 666 nt7.16□□□□□ -1.26
GIS2P53849 CCT4YDL143W 1587 nt7.16□□□□□ -1.26 RIP-Chip
GIS2P53849 HSP60YLR259C 1719 nt7.15□□□□□ -1.26 RIP-Chip
GIS2P53849 RAX1YOR301W 1308 nt7.15□□□□□ -1.26
GIS2P53849 GPI16YHR188C 1833 nt7.15□□□□□ -1.27
GIS2P53849 STB1YNL309W 1263 nt7.14□□□□□ -1.27
GIS2P53849 UBA4YHR111W 1323 nt7.13□□□□□ -1.27
GIS2P53849 DDR2YOL052C-A 186 nt7.13□□□□□ -1.27
GIS2P53849 SWC5YBR231C 912 nt7.13□□□□□ -1.27 RIP-Chip
GIS2P53849 RPM1RPM1 483 nt7.12□□□□□ -1.27
GIS2P53849 CCA1YER168C 1641 nt7.12□□□□□ -1.27
GIS2P53849 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt7.11□□□□□ -1.27
GIS2P53849 YSR3YKR053C 1215 nt7.11□□□□□ -1.27
GIS2P53849 YCR087WYCR087W 516 nt7.1□□□□□ -1.27
GIS2P53849 FUR4YBR021W 1902 nt7.09□□□□□ -1.27 RIP-Chip
GIS2P53849 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.09□□□□□ -1.27
GIS2P53849 ANP1YEL036C 1503 nt7.09□□□□□ -1.27
GIS2P53849 RBG1YAL036C 1110 nt7.08□□□□□ -1.28 RIP-Chip
GIS2P53849 VPS60YDR486C 690 nt7.06□□□□□ -1.28
GIS2P53849 TIM17YJL143W 477 nt7.05□□□□□ -1.28
GIS2P53849 SHB17YKR043C 816 nt7.05□□□□□ -1.28 RIP-Chip
GIS2P53849 YGR139WYGR139W 339 nt7.04□□□□□ -1.28
GIS2P53849 BNA2YJR078W 1362 nt7.04□□□□□ -1.28
GIS2P53849 FEN2YCR028C 1539 nt7.03□□□□□ -1.28 RIP-Chip
GIS2P53849 XYL2YLR070C 1071 nt7.03□□□□□ -1.28
GIS2P53849 ALG3YBL082C 1377 nt7.03□□□□□ -1.28
GIS2P53849 AIM45YPR004C 1035 nt7.02□□□□□ -1.29
GIS2P53849 MIC12YBR262C 321 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
GIS2P53849 ALG12YNR030W 1656 nt7□□□□□ -1.29
GIS2P53849 YLR111WYLR111W 333 nt7□□□□□ -1.29
GIS2P53849 UME6YDR207C 2511 nt7□□□□□ -1.29
GIS2P53849 AGP1YCL025C 1902 nt6.99□□□□□ -1.29
GIS2P53849 PRP4YPR178W 1398 nt6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
GIS2P53849 RAD51YER095W 1203 nt6.98□□□□□ -1.29
GIS2P53849 HHO1YPL127C 777 nt6.98□□□□□ -1.29
GIS2P53849 RET2YFR051C 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
GIS2P53849 YIR016WYIR016W 798 nt6.97□□□□□ -1.29
GIS2P53849 DPS1YLL018C 1674 nt6.96□□□□□ -1.3
GIS2P53849 YDR010CYDR010C 333 nt6.95□□□□□ -1.3
GIS2P53849 PHO89YBR296C 1725 nt6.95□□□□□ -1.3
GIS2P53849 STE4YOR212W 1272 nt6.94□□□□□ -1.3
GIS2P53849 DUS1YML080W 1272 nt6.93□□□□□ -1.3
GIS2P53849 YNR029CYNR029C 1290 nt6.93□□□□□ -1.3
GIS2P53849 YKR005CYKR005C 1578 nt6.92□□□□□ -1.3
GIS2P53849 MRP20YDR405W 792 nt6.92□□□□□ -1.3
GIS2P53849 AAC1YMR056C 930 nt6.92□□□□□ -1.3 RIP-Chip
GIS2P53849 YCL074WYCL074W 927 nt6.91□□□□□ -1.3
GIS2P53849 YLR349WYLR349W 507 nt6.9□□□□□ -1.3 RIP-Chip
GIS2P53849 SHM2YLR058C 1410 nt6.9□□□□□ -1.31
GIS2P53849 XDJ1YLR090W 1380 nt6.88□□□□□ -1.31 RIP-Chip
GIS2P53849 YGR201CYGR201C 678 nt6.88□□□□□ -1.31
GIS2P53849 BMT6YLR063W 1098 nt6.88□□□□□ -1.31
GIS2P53849 MCH5YOR306C 1566 nt6.87□□□□□ -1.31
GIS2P53849 ADH7YCR105W 1086 nt6.87□□□□□ -1.31
GIS2P53849 DUT1YBR252W 444 nt6.87□□□□□ -1.31
GIS2P53849 RAD23YEL037C 1197 nt6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms