Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLA2G16P53816 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLA2G16P53816 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLA2G16P53816 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLA2G16P53816 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLA2G16P53816 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLA2G16P53816 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLA2G16P53816 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLA2G16P53816 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PLA2G16P53816 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PLA2G16P53816 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PLA2G16P53816 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms