Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COPAP53621 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COPAP53621 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPAP53621 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPAP53621 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COPAP53621 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COPAP53621 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COPAP53621 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COPAP53621 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COPAP53621 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COPAP53621 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COPAP53621 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPAP53621 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPAP53621 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COPAP53621 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COPAP53621 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COPAP53621 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPAP53621 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPAP53621 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COPAP53621 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPAP53621 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COPAP53621 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPAP53621 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPAP53621 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COPAP53621 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPAP53621 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COPAP53621 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPAP53621 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPAP53621 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COPAP53621 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPAP53621 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPAP53621 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COPAP53621 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPAP53621 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COPAP53621 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPAP53621 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPAP53621 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COPAP53621 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
COPAP53621 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPAP53621 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPAP53621 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COPAP53621 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COPAP53621 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPAP53621 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COPAP53621 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COPAP53621 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COPAP53621 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPAP53621 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPAP53621 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPAP53621 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COPAP53621 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COPAP53621 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPAP53621 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPAP53621 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPAP53621 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COPAP53621 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COPAP53621 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPAP53621 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COPAP53621 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COPAP53621 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COPAP53621 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COPAP53621 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COPAP53621 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COPAP53621 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COPAP53621 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COPAP53621 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COPAP53621 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COPAP53621 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COPAP53621 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPAP53621 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPAP53621 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COPAP53621 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COPAP53621 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COPAP53621 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COPAP53621 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COPAP53621 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COPAP53621 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COPAP53621 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COPAP53621 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
COPAP53621 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPAP53621 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPAP53621 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPAP53621 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COPAP53621 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPAP53621 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COPAP53621 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPAP53621 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COPAP53621 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPAP53621 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPAP53621 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COPAP53621 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COPAP53621 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COPAP53621 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COPAP53621 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COPAP53621 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COPAP53621 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPAP53621 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COPAP53621 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COPAP53621 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COPAP53621 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms