Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DbtP53395 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DbtP53395 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DbtP53395 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DbtP53395 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DbtP53395 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DbtP53395 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DbtP53395 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DbtP53395 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DbtP53395 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DbtP53395 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DbtP53395 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DbtP53395 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DbtP53395 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DbtP53395 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DbtP53395 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DbtP53395 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DbtP53395 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DbtP53395 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DbtP53395 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DbtP53395 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DbtP53395 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DbtP53395 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DbtP53395 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DbtP53395 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DbtP53395 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DbtP53395 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DbtP53395 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DbtP53395 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DbtP53395 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DbtP53395 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DbtP53395 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DbtP53395 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DbtP53395 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DbtP53395 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DbtP53395 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DbtP53395 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DbtP53395 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DbtP53395 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DbtP53395 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DbtP53395 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DbtP53395 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DbtP53395 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DbtP53395 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DbtP53395 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DbtP53395 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DbtP53395 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DbtP53395 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DbtP53395 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DbtP53395 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DbtP53395 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DbtP53395 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DbtP53395 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DbtP53395 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DbtP53395 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DbtP53395 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DbtP53395 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DbtP53395 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DbtP53395 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DbtP53395 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DbtP53395 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DbtP53395 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DbtP53395 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DbtP53395 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DbtP53395 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DbtP53395 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DbtP53395 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DbtP53395 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DbtP53395 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DbtP53395 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DbtP53395 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DbtP53395 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DbtP53395 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DbtP53395 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DbtP53395 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DbtP53395 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DbtP53395 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DbtP53395 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DbtP53395 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DbtP53395 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DbtP53395 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DbtP53395 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DbtP53395 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DbtP53395 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DbtP53395 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DbtP53395 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DbtP53395 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DbtP53395 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DbtP53395 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DbtP53395 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DbtP53395 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DbtP53395 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DbtP53395 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DbtP53395 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DbtP53395 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DbtP53395 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DbtP53395 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DbtP53395 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DbtP53395 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DbtP53395 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms