Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem165P52875 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem165P52875 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem165P52875 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem165P52875 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmem165P52875 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem165P52875 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem165P52875 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem165P52875 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem165P52875 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem165P52875 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem165P52875 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem165P52875 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem165P52875 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem165P52875 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem165P52875 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms