Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EFNA5P52803 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EFNA5P52803 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EFNA5P52803 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EFNA5P52803 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EFNA5P52803 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EFNA5P52803 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EFNA5P52803 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFNA5P52803 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EFNA5P52803 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EFNA5P52803 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms