Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK2P51955 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEK2P51955 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK2P51955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK2P51955 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK2P51955 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK2P51955 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK2P51955 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK2P51955 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK2P51955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK2P51955 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK2P51955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK2P51955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK2P51955 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK2P51955 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK2P51955 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK2P51955 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK2P51955 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK2P51955 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK2P51955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK2P51955 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK2P51955 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK2P51955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK2P51955 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK2P51955 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK2P51955 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK2P51955 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK2P51955 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK2P51955 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK2P51955 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK2P51955 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK2P51955 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK2P51955 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK2P51955 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK2P51955 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK2P51955 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK2P51955 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK2P51955 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK2P51955 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK2P51955 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK2P51955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK2P51955 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK2P51955 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK2P51955 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK2P51955 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK2P51955 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK2P51955 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK2P51955 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK2P51955 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK2P51955 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK2P51955 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEK2P51955 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEK2P51955 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK2P51955 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK2P51955 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK2P51955 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEK2P51955 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEK2P51955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEK2P51955 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK2P51955 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK2P51955 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEK2P51955 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK2P51955 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK2P51955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK2P51955 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK2P51955 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK2P51955 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK2P51955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK2P51955 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK2P51955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK2P51955 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK2P51955 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK2P51955 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK2P51955 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK2P51955 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK2P51955 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK2P51955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEK2P51955 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK2P51955 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK2P51955 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEK2P51955 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEK2P51955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK2P51955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK2P51955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEK2P51955 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEK2P51955 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK2P51955 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK2P51955 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEK2P51955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK2P51955 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEK2P51955 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEK2P51955 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEK2P51955 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEK2P51955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms