Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
SMARCA4P51532 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
SMARCA4P51532 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.87
SMARCA4P51532 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
SMARCA4P51532 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.7■■■■■ 5.87
SMARCA4P51532 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC51.7■■■■■ 5.87
SMARCA4P51532 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC51.68■■■■■ 5.86
SMARCA4P51532 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
SMARCA4P51532 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC51.66■■■■■ 5.86
SMARCA4P51532 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
SMARCA4P51532 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC51.63■■■■■ 5.86
SMARCA4P51532 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC51.58■■■■■ 5.85
SMARCA4P51532 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.55■■■■■ 5.84
SMARCA4P51532 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC51.49■■■■■ 5.83
SMARCA4P51532 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
SMARCA4P51532 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
SMARCA4P51532 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
SMARCA4P51532 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC51.44■■■■■ 5.83
SMARCA4P51532 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC51.42■■■■■ 5.82
SMARCA4P51532 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
SMARCA4P51532 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
SMARCA4P51532 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC51.37■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.34■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC51.33■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
SMARCA4P51532 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC51.3■■■■■ 5.8
SMARCA4P51532 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC51.29■■■■■ 5.8
SMARCA4P51532 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
SMARCA4P51532 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
SMARCA4P51532 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
SMARCA4P51532 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
SMARCA4P51532 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
SMARCA4P51532 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC51.2■■■■■ 5.79
SMARCA4P51532 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC51.16■■■■■ 5.78
SMARCA4P51532 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC51.16■■■■■ 5.78
SMARCA4P51532 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
SMARCA4P51532 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.13■■■■■ 5.78
SMARCA4P51532 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
SMARCA4P51532 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
SMARCA4P51532 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
SMARCA4P51532 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
SMARCA4P51532 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
SMARCA4P51532 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC51.05■■■■■ 5.76
SMARCA4P51532 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC51.02■■■■■ 5.76
SMARCA4P51532 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC51■■■■■ 5.75
SMARCA4P51532 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC50.98■■■■■ 5.75
SMARCA4P51532 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
SMARCA4P51532 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC50.94■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC50.93■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC50.9■■■■■ 5.74
SMARCA4P51532 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.87■■■■■ 5.73
SMARCA4P51532 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.87■■■■■ 5.73
SMARCA4P51532 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.85■■■■■ 5.73
SMARCA4P51532 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC50.83■■■■■ 5.73
SMARCA4P51532 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC50.81■■■■■ 5.72
SMARCA4P51532 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC50.79■■■■■ 5.72
SMARCA4P51532 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
SMARCA4P51532 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
SMARCA4P51532 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
SMARCA4P51532 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC50.73■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
SMARCA4P51532 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
SMARCA4P51532 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
SMARCA4P51532 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC50.58■■■■■ 5.69
SMARCA4P51532 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC50.58■■■■■ 5.69
SMARCA4P51532 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
SMARCA4P51532 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
SMARCA4P51532 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
SMARCA4P51532 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.55■■■■■ 5.68
SMARCA4P51532 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.55■■■■■ 5.68
SMARCA4P51532 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
SMARCA4P51532 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC50.49■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC50.47■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
SMARCA4P51532 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC50.4■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
SMARCA4P51532 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms