Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPT1P50897 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPT1P50897 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPT1P50897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPT1P50897 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPT1P50897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPT1P50897 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPT1P50897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPT1P50897 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPT1P50897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPT1P50897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPT1P50897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPT1P50897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPT1P50897 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPT1P50897 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPT1P50897 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPT1P50897 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPT1P50897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPT1P50897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPT1P50897 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPT1P50897 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPT1P50897 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPT1P50897 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPT1P50897 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPT1P50897 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPT1P50897 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPT1P50897 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPT1P50897 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPT1P50897 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPT1P50897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPT1P50897 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPT1P50897 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPT1P50897 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPT1P50897 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPT1P50897 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPT1P50897 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPT1P50897 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPT1P50897 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPT1P50897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPT1P50897 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPT1P50897 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPT1P50897 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPT1P50897 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPT1P50897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPT1P50897 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPT1P50897 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPT1P50897 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPT1P50897 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPT1P50897 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPT1P50897 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPT1P50897 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPT1P50897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms