Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa6P50704 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa6P50704 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa6P50704 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa6P50704 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa6P50704 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa6P50704 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa6P50704 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Defa6P50704 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa6P50704 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa6P50704 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa6P50704 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa6P50704 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa6P50704 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa6P50704 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa6P50704 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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