Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TspoP50637 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TspoP50637 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TspoP50637 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TspoP50637 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TspoP50637 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TspoP50637 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TspoP50637 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TspoP50637 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TspoP50637 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TspoP50637 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TspoP50637 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TspoP50637 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TspoP50637 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TspoP50637 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TspoP50637 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TspoP50637 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TspoP50637 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TspoP50637 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TspoP50637 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TspoP50637 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TspoP50637 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TspoP50637 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TspoP50637 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TspoP50637 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TspoP50637 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TspoP50637 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TspoP50637 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TspoP50637 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TspoP50637 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TspoP50637 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TspoP50637 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TspoP50637 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TspoP50637 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TspoP50637 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TspoP50637 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TspoP50637 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TspoP50637 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TspoP50637 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TspoP50637 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TspoP50637 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TspoP50637 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TspoP50637 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TspoP50637 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TspoP50637 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TspoP50637 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TspoP50637 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TspoP50637 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TspoP50637 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TspoP50637 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TspoP50637 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TspoP50637 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TspoP50637 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TspoP50637 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TspoP50637 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TspoP50637 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TspoP50637 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TspoP50637 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TspoP50637 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TspoP50637 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TspoP50637 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TspoP50637 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TspoP50637 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TspoP50637 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TspoP50637 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TspoP50637 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TspoP50637 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TspoP50637 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TspoP50637 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TspoP50637 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TspoP50637 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TspoP50637 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TspoP50637 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TspoP50637 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TspoP50637 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TspoP50637 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TspoP50637 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TspoP50637 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TspoP50637 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TspoP50637 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TspoP50637 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TspoP50637 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TspoP50637 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TspoP50637 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TspoP50637 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TspoP50637 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TspoP50637 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TspoP50637 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TspoP50637 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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