Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERFP50548 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERFP50548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERFP50548 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERFP50548 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERFP50548 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERFP50548 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERFP50548 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERFP50548 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERFP50548 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERFP50548 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERFP50548 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERFP50548 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERFP50548 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERFP50548 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERFP50548 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERFP50548 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERFP50548 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERFP50548 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERFP50548 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERFP50548 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERFP50548 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERFP50548 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERFP50548 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERFP50548 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERFP50548 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERFP50548 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERFP50548 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERFP50548 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERFP50548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERFP50548 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERFP50548 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERFP50548 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERFP50548 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERFP50548 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERFP50548 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERFP50548 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERFP50548 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERFP50548 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERFP50548 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERFP50548 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERFP50548 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERFP50548 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERFP50548 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERFP50548 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERFP50548 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERFP50548 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERFP50548 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERFP50548 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERFP50548 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERFP50548 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERFP50548 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERFP50548 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERFP50548 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERFP50548 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERFP50548 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERFP50548 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERFP50548 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERFP50548 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERFP50548 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERFP50548 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERFP50548 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERFP50548 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERFP50548 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ERFP50548 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERFP50548 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERFP50548 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERFP50548 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERFP50548 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERFP50548 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERFP50548 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERFP50548 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERFP50548 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERFP50548 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERFP50548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERFP50548 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ERFP50548 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERFP50548 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERFP50548 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERFP50548 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERFP50548 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERFP50548 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERFP50548 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERFP50548 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERFP50548 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERFP50548 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERFP50548 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERFP50548 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERFP50548 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERFP50548 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERFP50548 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERFP50548 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERFP50548 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERFP50548 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERFP50548 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERFP50548 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERFP50548 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERFP50548 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERFP50548 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERFP50548 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms