Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRP3P50461 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRP3P50461 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRP3P50461 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRP3P50461 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRP3P50461 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRP3P50461 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRP3P50461 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSRP3P50461 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRP3P50461 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRP3P50461 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRP3P50461 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRP3P50461 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRP3P50461 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRP3P50461 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRP3P50461 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRP3P50461 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRP3P50461 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRP3P50461 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP3P50461 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP3P50461 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP3P50461 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRP3P50461 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSRP3P50461 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRP3P50461 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSRP3P50461 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSRP3P50461 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSRP3P50461 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSRP3P50461 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms