Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hoxc13P50207 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hoxc13P50207 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hoxc13P50207 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxc13P50207 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hoxc13P50207 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hoxc13P50207 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxc13P50207 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc13P50207 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxc13P50207 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hoxc13P50207 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxc13P50207 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc13P50207 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxc13P50207 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxc13P50207 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hoxc13P50207 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc13P50207 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxc13P50207 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxc13P50207 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxc13P50207 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc13P50207 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc13P50207 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc13P50207 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc13P50207 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc13P50207 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc13P50207 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hoxc13P50207 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxc13P50207 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hoxc13P50207 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Hoxc13P50207 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Hoxc13P50207 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxc13P50207 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hoxc13P50207 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms