Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB3P49720 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSMB3P49720 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB3P49720 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB3P49720 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB3P49720 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB3P49720 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB3P49720 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB3P49720 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB3P49720 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB3P49720 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms