Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRPC1P48995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRPC1P48995 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRPC1P48995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRPC1P48995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRPC1P48995 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPC1P48995 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC1P48995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC1P48995 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC1P48995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRPC1P48995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms