Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PcntP48725 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PcntP48725 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PcntP48725 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PcntP48725 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PcntP48725 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PcntP48725 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PcntP48725 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PcntP48725 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PcntP48725 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PcntP48725 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PcntP48725 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcntP48725 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcntP48725 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PcntP48725 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcntP48725 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcntP48725 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcntP48725 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcntP48725 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcntP48725 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PcntP48725 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PcntP48725 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PcntP48725 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PcntP48725 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PcntP48725 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcntP48725 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PcntP48725 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PcntP48725 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcntP48725 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcntP48725 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcntP48725 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PcntP48725 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PcntP48725 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcntP48725 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcntP48725 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcntP48725 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PcntP48725 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PcntP48725 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PcntP48725 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PcntP48725 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PcntP48725 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PcntP48725 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PcntP48725 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PcntP48725 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PcntP48725 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PcntP48725 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PcntP48725 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PcntP48725 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PcntP48725 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PcntP48725 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PcntP48725 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PcntP48725 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PcntP48725 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PcntP48725 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PcntP48725 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PcntP48725 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PcntP48725 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PcntP48725 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PcntP48725 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PcntP48725 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PcntP48725 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PcntP48725 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PcntP48725 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PcntP48725 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PcntP48725 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PcntP48725 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PcntP48725 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PcntP48725 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PcntP48725 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PcntP48725 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PcntP48725 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PcntP48725 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PcntP48725 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PcntP48725 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PcntP48725 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PcntP48725 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PcntP48725 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PcntP48725 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PcntP48725 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PcntP48725 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PcntP48725 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PcntP48725 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PcntP48725 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PcntP48725 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PcntP48725 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PcntP48725 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PcntP48725 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PcntP48725 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PcntP48725 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PcntP48725 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PcntP48725 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PcntP48725 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PcntP48725 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PcntP48725 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PcntP48725 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PcntP48725 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PcntP48725 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PcntP48725 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PcntP48725 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PcntP48725 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms