Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP5G3P48201 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5G3P48201 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5G3P48201 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5G3P48201 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5G3P48201 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP5G3P48201 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP5G3P48201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5G3P48201 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP5G3P48201 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5G3P48201 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5G3P48201 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5G3P48201 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP5G3P48201 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP5G3P48201 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5G3P48201 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP5G3P48201 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5G3P48201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5G3P48201 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms