Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPA2P48052 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA2P48052 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPA2P48052 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPA2P48052 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPA2P48052 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA2P48052 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPA2P48052 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPA2P48052 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPA2P48052 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CPA2P48052 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPA2P48052 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA2P48052 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPA2P48052 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA2P48052 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA2P48052 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPA2P48052 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPA2P48052 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA2P48052 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPA2P48052 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPA2P48052 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA2P48052 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPA2P48052 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPA2P48052 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA2P48052 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPA2P48052 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPA2P48052 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA2P48052 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPA2P48052 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA2P48052 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA2P48052 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA2P48052 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPA2P48052 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPA2P48052 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA2P48052 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPA2P48052 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA2P48052 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA2P48052 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPA2P48052 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA2P48052 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA2P48052 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CPA2P48052 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPA2P48052 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA2P48052 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPA2P48052 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPA2P48052 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA2P48052 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA2P48052 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPA2P48052 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPA2P48052 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA2P48052 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPA2P48052 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA2P48052 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPA2P48052 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPA2P48052 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA2P48052 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPA2P48052 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPA2P48052 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA2P48052 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPA2P48052 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPA2P48052 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA2P48052 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CPA2P48052 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA2P48052 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CPA2P48052 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA2P48052 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA2P48052 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA2P48052 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA2P48052 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA2P48052 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA2P48052 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA2P48052 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA2P48052 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA2P48052 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA2P48052 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA2P48052 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA2P48052 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA2P48052 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA2P48052 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA2P48052 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA2P48052 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA2P48052 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA2P48052 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA2P48052 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA2P48052 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA2P48052 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA2P48052 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA2P48052 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA2P48052 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA2P48052 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA2P48052 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA2P48052 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA2P48052 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA2P48052 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA2P48052 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA2P48052 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA2P48052 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA2P48052 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA2P48052 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA2P48052 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms