Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP5OP48047 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP5OP48047 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP5OP48047 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP5OP48047 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP5OP48047 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP5OP48047 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP5OP48047 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP5OP48047 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP5OP48047 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP5OP48047 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP5OP48047 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP5OP48047 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP5OP48047 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP5OP48047 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP5OP48047 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP5OP48047 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP5OP48047 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2555.7 ms