Protein–RNA interactions for Protein: P48016

ATH1, Vacuolar acid trehalase, yeastyeast

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Length 1,211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATH1P48016 YJR154WYJR154W 1041 nt11.85□□□□□ -0.51
ATH1P48016 FTH1YBR207W 1398 nt11.84□□□□□ -0.51
ATH1P48016 PHO92YDR374C 921 nt11.84□□□□□ -0.51
ATH1P48016 AST1YBL069W 1290 nt11.84□□□□□ -0.51
ATH1P48016 RPP2AYOL039W 321 nt11.83□□□□□ -0.52
ATH1P48016 YLR036CYLR036C 612 nt11.82□□□□□ -0.52
ATH1P48016 PEX27YOR193W 1131 nt11.81□□□□□ -0.52
ATH1P48016 ART5YGR068C 1761 nt11.79□□□□□ -0.52
ATH1P48016 YHL044WYHL044W 708 nt11.78□□□□□ -0.52
ATH1P48016 PET9YBL030C 957 nt11.78□□□□□ -0.52
ATH1P48016 MPC1YGL080W 393 nt11.77□□□□□ -0.53
ATH1P48016 COG1YGL223C 1254 nt11.76□□□□□ -0.53
ATH1P48016 TAT1YBR069C 1860 nt11.75□□□□□ -0.53
ATH1P48016 YML079WYML079W 606 nt11.75□□□□□ -0.53
ATH1P48016 YHP1YDR451C 1062 nt11.74□□□□□ -0.53
ATH1P48016 PIC2YER053C 903 nt11.74□□□□□ -0.53
ATH1P48016 STB1YNL309W 1263 nt11.74□□□□□ -0.53
ATH1P48016 FRD1YEL047C 1413 nt11.73□□□□□ -0.53
ATH1P48016 PTH1YHR189W 573 nt11.73□□□□□ -0.53
ATH1P48016 YKL030WYKL030W 606 nt11.73□□□□□ -0.53
ATH1P48016 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.72□□□□□ -0.53
ATH1P48016 YLR235CYLR235C 399 nt11.7□□□□□ -0.54
ATH1P48016 YCL042WYCL042W 360 nt11.7□□□□□ -0.54
ATH1P48016 ARC19YKL013C 516 nt11.68□□□□□ -0.54
ATH1P48016 NAT5YOR253W 531 nt11.68□□□□□ -0.54
ATH1P48016 PAB1YER165W 1734 nt11.67□□□□□ -0.54
ATH1P48016 PTP1YDL230W 1008 nt11.67□□□□□ -0.54
ATH1P48016 BNS1YGR230W 414 nt11.67□□□□□ -0.54
ATH1P48016 UBC12YLR306W 567 nt11.67□□□□□ -0.54
ATH1P48016 MRPL36YBR122C 534 nt11.67□□□□□ -0.54
ATH1P48016 ARP6YLR085C 1317 nt11.66□□□□□ -0.54
ATH1P48016 MPS2YGL075C 1164 nt11.66□□□□□ -0.54
ATH1P48016 GFD2YCL036W 1701 nt11.66□□□□□ -0.54
ATH1P48016 DED1YOR204W 1815 nt11.65□□□□□ -0.55
ATH1P48016 GTT3YEL017W 1014 nt11.64□□□□□ -0.55
ATH1P48016 COX3Q0275 810 nt11.64□□□□□ -0.55
ATH1P48016 MEP2YNL142W 1500 nt11.64□□□□□ -0.55
ATH1P48016 HOS2YGL194C 1359 nt11.63□□□□□ -0.55
ATH1P48016 FAR3YMR052W 615 nt11.62□□□□□ -0.55
ATH1P48016 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt11.6□□□□□ -0.55
ATH1P48016 RRD1YIL153W 1182 nt11.6□□□□□ -0.55
ATH1P48016 BNA3YJL060W 1335 nt11.6□□□□□ -0.55
ATH1P48016 LCB1YMR296C 1677 nt11.59□□□□□ -0.55
ATH1P48016 YBL081WYBL081W 1107 nt11.59□□□□□ -0.55
ATH1P48016 YTH1YPR107C 627 nt11.59□□□□□ -0.55
ATH1P48016 RUF21RUF21 707 nt11.58□□□□□ -0.56
ATH1P48016 SBA1YKL117W 651 nt11.57□□□□□ -0.56
ATH1P48016 AIM41YOR215C 558 nt11.57□□□□□ -0.56
ATH1P48016 YLR311CYLR311C 348 nt11.56□□□□□ -0.56
ATH1P48016 VPS28YPL065W 729 nt11.56□□□□□ -0.56
ATH1P48016 PAU16YKL224C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
ATH1P48016 SED5YLR026C 1023 nt11.55□□□□□ -0.56
ATH1P48016 SOR2YDL246C 1074 nt11.54□□□□□ -0.56
ATH1P48016 RRT5YFR032C 870 nt11.54□□□□□ -0.56
ATH1P48016 SOR1YJR159W 1074 nt11.54□□□□□ -0.56
ATH1P48016 ICE2YIL090W 1476 nt11.54□□□□□ -0.56
ATH1P48016 DCW1YKL046C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
ATH1P48016 YNL234WYNL234W 1281 nt11.52□□□□□ -0.57
ATH1P48016 REC114YMR133W 1287 nt11.5□□□□□ -0.57
ATH1P48016 FMT1YBL013W 1206 nt11.49□□□□□ -0.57
ATH1P48016 DIA1YMR316W 1011 nt11.48□□□□□ -0.57
ATH1P48016 RTS2YOR077W 699 nt11.48□□□□□ -0.57
ATH1P48016 APM1YPL259C 1428 nt11.47□□□□□ -0.57
ATH1P48016 YDL157CYDL157C 357 nt11.47□□□□□ -0.57
ATH1P48016 YPR1YDR368W 939 nt11.47□□□□□ -0.57
ATH1P48016 YFR018CYFR018C 1092 nt11.47□□□□□ -0.57
ATH1P48016 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.47□□□□□ -0.57
ATH1P48016 TSR2YLR435W 618 nt11.46□□□□□ -0.57
ATH1P48016 ATG17YLR423C 1254 nt11.44□□□□□ -0.58
ATH1P48016 YNL040WYNL040W 1371 nt11.42□□□□□ -0.58
ATH1P48016 SUA5YGL169W 1281 nt11.42□□□□□ -0.58
ATH1P48016 YMR147WYMR147W 672 nt11.42□□□□□ -0.58
ATH1P48016 FMP52YER004W 696 nt11.41□□□□□ -0.58
ATH1P48016 CWP1YKL096W 720 nt11.41□□□□□ -0.58
ATH1P48016 NEJ1YLR265C 1029 nt11.41□□□□□ -0.58
ATH1P48016 TIM23YNR017W 669 nt11.41□□□□□ -0.58
ATH1P48016 PEX34YCL056C 435 nt11.4□□□□□ -0.58
ATH1P48016 PUS5YLR165C 765 nt11.38□□□□□ -0.59
ATH1P48016 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt11.37□□□□□ -0.59
ATH1P48016 CUE1YMR264W 612 nt11.37□□□□□ -0.59
ATH1P48016 TAZ1YPR140W 1146 nt11.37□□□□□ -0.59
ATH1P48016 PRE6YOL038W 765 nt11.36□□□□□ -0.59
ATH1P48016 NDJ1YOL104C 1059 nt11.36□□□□□ -0.59
ATH1P48016 AME1YBR211C 975 nt11.36□□□□□ -0.59
ATH1P48016 EMI2YDR516C 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
ATH1P48016 IRC15YPL017C 1500 nt11.35□□□□□ -0.59
ATH1P48016 YHR054CYHR054C 1065 nt11.35□□□□□ -0.59
ATH1P48016 GET2YER083C 858 nt11.34□□□□□ -0.59
ATH1P48016 RSA3YLR221C 663 nt11.34□□□□□ -0.59
ATH1P48016 DIC1YLR348C 897 nt11.34□□□□□ -0.59
ATH1P48016 SCO2YBR024W 906 nt11.34□□□□□ -0.59
ATH1P48016 SNF6YHL025W 999 nt11.33□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YLR179CYLR179C 606 nt11.33□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YPR064WYPR064W 420 nt11.33□□□□□ -0.6
ATH1P48016 ADH2YMR303C 1047 nt11.32□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YDL158CYDL158C 309 nt11.31□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YGR011WYGR011W 327 nt11.3□□□□□ -0.6
ATH1P48016 FHN1YGR131W 525 nt11.3□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YIL100WYIL100W 354 nt11.3□□□□□ -0.6
ATH1P48016 YMR074CYMR074C 438 nt11.3□□□□□ -0.6
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