Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GALR1P47211 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALR1P47211 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALR1P47211 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GALR1P47211 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GALR1P47211 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALR1P47211 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALR1P47211 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALR1P47211 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GALR1P47211 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALR1P47211 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GALR1P47211 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALR1P47211 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GALR1P47211 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GALR1P47211 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALR1P47211 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALR1P47211 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GALR1P47211 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALR1P47211 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GALR1P47211 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GALR1P47211 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GALR1P47211 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALR1P47211 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GALR1P47211 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GALR1P47211 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALR1P47211 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GALR1P47211 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALR1P47211 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GALR1P47211 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALR1P47211 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GALR1P47211 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GALR1P47211 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GALR1P47211 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GALR1P47211 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GALR1P47211 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GALR1P47211 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GALR1P47211 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GALR1P47211 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GALR1P47211 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GALR1P47211 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GALR1P47211 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GALR1P47211 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GALR1P47211 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GALR1P47211 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GALR1P47211 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GALR1P47211 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GALR1P47211 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GALR1P47211 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GALR1P47211 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GALR1P47211 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GALR1P47211 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GALR1P47211 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GALR1P47211 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GALR1P47211 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GALR1P47211 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GALR1P47211 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GALR1P47211 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GALR1P47211 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GALR1P47211 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GALR1P47211 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GALR1P47211 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GALR1P47211 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GALR1P47211 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GALR1P47211 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GALR1P47211 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GALR1P47211 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GALR1P47211 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GALR1P47211 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GALR1P47211 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GALR1P47211 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GALR1P47211 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GALR1P47211 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GALR1P47211 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GALR1P47211 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GALR1P47211 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GALR1P47211 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GALR1P47211 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GALR1P47211 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GALR1P47211 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GALR1P47211 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GALR1P47211 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GALR1P47211 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALR1P47211 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALR1P47211 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALR1P47211 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALR1P47211 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALR1P47211 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALR1P47211 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALR1P47211 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GALR1P47211 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GALR1P47211 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALR1P47211 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GALR1P47211 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALR1P47211 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALR1P47211 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALR1P47211 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GALR1P47211 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GALR1P47211 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GALR1P47211 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GALR1P47211 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms