Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNPDA1P46926 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GNPDA1P46926 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GNPDA1P46926 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GNPDA1P46926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNPDA1P46926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNPDA1P46926 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GNPDA1P46926 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GNPDA1P46926 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNPDA1P46926 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPDA1P46926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPDA1P46926 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GNPDA1P46926 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPDA1P46926 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPDA1P46926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPDA1P46926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPDA1P46926 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPDA1P46926 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPDA1P46926 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNPDA1P46926 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPDA1P46926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms