Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHKA1P46020 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHKA1P46020 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PHKA1P46020 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PHKA1P46020 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHKA1P46020 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHKA1P46020 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHKA1P46020 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHKA1P46020 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHKA1P46020 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PHKA1P46020 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHKA1P46020 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PHKA1P46020 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHKA1P46020 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHKA1P46020 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHKA1P46020 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PHKA1P46020 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHKA1P46020 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHKA1P46020 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PHKA1P46020 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PHKA1P46020 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHKA1P46020 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHKA1P46020 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHKA1P46020 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms