Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF5P43026 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF5P43026 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GDF5P43026 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF5P43026 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF5P43026 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GDF5P43026 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF5P43026 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GDF5P43026 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF5P43026 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF5P43026 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF5P43026 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF5P43026 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF5P43026 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF5P43026 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF5P43026 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF5P43026 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF5P43026 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF5P43026 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF5P43026 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF5P43026 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF5P43026 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF5P43026 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF5P43026 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF5P43026 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GDF5P43026 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GDF5P43026 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GDF5P43026 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF5P43026 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF5P43026 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GDF5P43026 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF5P43026 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GDF5P43026 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF5P43026 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDF5P43026 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDF5P43026 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF5P43026 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF5P43026 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF5P43026 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GDF5P43026 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF5P43026 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF5P43026 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF5P43026 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GDF5P43026 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF5P43026 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GDF5P43026 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF5P43026 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF5P43026 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GDF5P43026 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF5P43026 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF5P43026 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GDF5P43026 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GDF5P43026 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDF5P43026 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF5P43026 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GDF5P43026 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF5P43026 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GDF5P43026 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GDF5P43026 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF5P43026 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GDF5P43026 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF5P43026 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDF5P43026 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF5P43026 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GDF5P43026 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF5P43026 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF5P43026 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF5P43026 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GDF5P43026 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDF5P43026 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF5P43026 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF5P43026 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GDF5P43026 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GDF5P43026 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF5P43026 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF5P43026 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GDF5P43026 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GDF5P43026 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF5P43026 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GDF5P43026 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF5P43026 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF5P43026 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF5P43026 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDF5P43026 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF5P43026 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF5P43026 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GDF5P43026 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF5P43026 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GDF5P43026 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GDF5P43026 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GDF5P43026 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GDF5P43026 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDF5P43026 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDF5P43026 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF5P43026 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF5P43026 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF5P43026 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDF5P43026 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDF5P43026 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF5P43026 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms