Protein–RNA interactions for Protein: P42866

Oprm1, Mu-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprm1P42866 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oprm1P42866 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Oprm1P42866 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Oprm1P42866 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Oprm1P42866 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Oprm1P42866 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Oprm1P42866 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Oprm1P42866 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Oprm1P42866 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Oprm1P42866 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Oprm1P42866 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Oprm1P42866 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Oprm1P42866 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Oprm1P42866 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms