Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP2P42575 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP2P42575 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP2P42575 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP2P42575 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP2P42575 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP2P42575 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP2P42575 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP2P42575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP2P42575 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP2P42575 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP2P42575 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASP2P42575 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP2P42575 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP2P42575 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP2P42575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP2P42575 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP2P42575 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP2P42575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP2P42575 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP2P42575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP2P42575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASP2P42575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CASP2P42575 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP2P42575 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASP2P42575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP2P42575 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP2P42575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CASP2P42575 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP2P42575 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASP2P42575 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CASP2P42575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASP2P42575 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP2P42575 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASP2P42575 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP2P42575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP2P42575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP2P42575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP2P42575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASP2P42575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP2P42575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP2P42575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASP2P42575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP2P42575 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP2P42575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASP2P42575 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP2P42575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP2P42575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASP2P42575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP2P42575 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASP2P42575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP2P42575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP2P42575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP2P42575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP2P42575 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP2P42575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP2P42575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP2P42575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP2P42575 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP2P42575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP2P42575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP2P42575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP2P42575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP2P42575 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP2P42575 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP2P42575 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP2P42575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP2P42575 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP2P42575 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASP2P42575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP2P42575 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASP2P42575 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP2P42575 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASP2P42575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASP2P42575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP2P42575 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP2P42575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASP2P42575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP2P42575 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP2P42575 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP2P42575 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP2P42575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP2P42575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP2P42575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP2P42575 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP2P42575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP2P42575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP2P42575 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP2P42575 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP2P42575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP2P42575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP2P42575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP2P42575 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP2P42575 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP2P42575 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms