Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HALP42357 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HALP42357 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HALP42357 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HALP42357 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HALP42357 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HALP42357 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HALP42357 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HALP42357 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HALP42357 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HALP42357 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HALP42357 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HALP42357 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HALP42357 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HALP42357 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HALP42357 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HALP42357 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HALP42357 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HALP42357 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HALP42357 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HALP42357 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HALP42357 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HALP42357 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HALP42357 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HALP42357 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HALP42357 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HALP42357 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HALP42357 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HALP42357 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HALP42357 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HALP42357 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HALP42357 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HALP42357 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HALP42357 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HALP42357 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HALP42357 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HALP42357 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HALP42357 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HALP42357 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HALP42357 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HALP42357 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HALP42357 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HALP42357 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HALP42357 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HALP42357 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HALP42357 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HALP42357 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HALP42357 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HALP42357 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HALP42357 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HALP42357 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HALP42357 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HALP42357 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HALP42357 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HALP42357 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HALP42357 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HALP42357 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HALP42357 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HALP42357 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HALP42357 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HALP42357 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HALP42357 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HALP42357 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HALP42357 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HALP42357 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HALP42357 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HALP42357 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HALP42357 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HALP42357 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HALP42357 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HALP42357 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HALP42357 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HALP42357 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HALP42357 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HALP42357 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HALP42357 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HALP42357 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HALP42357 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HALP42357 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HALP42357 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HALP42357 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HALP42357 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HALP42357 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HALP42357 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HALP42357 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HALP42357 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HALP42357 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HALP42357 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HALP42357 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HALP42357 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HALP42357 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HALP42357 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HALP42357 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HALP42357 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HALP42357 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms