Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GRIA1P42261 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GRIA1P42261 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GRIA1P42261 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GRIA1P42261 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIA1P42261 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIA1P42261 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIA1P42261 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA1P42261 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIA1P42261 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIA1P42261 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIA1P42261 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIA1P42261 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIA1P42261 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GRIA1P42261 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GRIA1P42261 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms