Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMELP40967 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMELP40967 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMELP40967 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMELP40967 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMELP40967 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMELP40967 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMELP40967 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PMELP40967 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMELP40967 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMELP40967 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMELP40967 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PMELP40967 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PMELP40967 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PMELP40967 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMELP40967 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMELP40967 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PMELP40967 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMELP40967 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMELP40967 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMELP40967 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMELP40967 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMELP40967 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMELP40967 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMELP40967 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMELP40967 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMELP40967 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMELP40967 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PMELP40967 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMELP40967 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PMELP40967 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMELP40967 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMELP40967 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMELP40967 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMELP40967 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMELP40967 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMELP40967 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMELP40967 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMELP40967 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMELP40967 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMELP40967 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMELP40967 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMELP40967 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMELP40967 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMELP40967 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMELP40967 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMELP40967 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMELP40967 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMELP40967 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMELP40967 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMELP40967 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMELP40967 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMELP40967 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMELP40967 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMELP40967 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMELP40967 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMELP40967 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMELP40967 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMELP40967 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMELP40967 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMELP40967 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMELP40967 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMELP40967 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMELP40967 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMELP40967 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMELP40967 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMELP40967 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMELP40967 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMELP40967 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMELP40967 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMELP40967 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMELP40967 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMELP40967 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMELP40967 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMELP40967 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMELP40967 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMELP40967 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMELP40967 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMELP40967 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMELP40967 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMELP40967 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMELP40967 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMELP40967 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMELP40967 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMELP40967 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMELP40967 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMELP40967 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PMELP40967 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PMELP40967 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms