Protein–RNA interactions for Protein: P40516

EFM4, Protein-lysine N-methyltransferase EFM4, yeastyeast

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFM4P40516 YLR235CYLR235C 399 nt11.66□□□□□ -0.54
EFM4P40516 TIM23YNR017W 669 nt11.66□□□□□ -0.54
EFM4P40516 ANP1YEL036C 1503 nt11.65□□□□□ -0.54
EFM4P40516 YLR179CYLR179C 606 nt11.65□□□□□ -0.54
EFM4P40516 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.63□□□□□ -0.55
EFM4P40516 STB1YNL309W 1263 nt11.63□□□□□ -0.55
EFM4P40516 FUR4YBR021W 1902 nt11.62□□□□□ -0.55
EFM4P40516 AQY1YPR192W 918 nt11.61□□□□□ -0.55
EFM4P40516 GLK1YCL040W 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
EFM4P40516 SPC25YER018C 666 nt11.58□□□□□ -0.56
EFM4P40516 FEN2YCR028C 1539 nt11.58□□□□□ -0.56
EFM4P40516 BNA2YJR078W 1362 nt11.57□□□□□ -0.56
EFM4P40516 WSC2YNL283C 1512 nt11.55□□□□□ -0.56
EFM4P40516 YKL030WYKL030W 606 nt11.54□□□□□ -0.56
EFM4P40516 VPS60YDR486C 690 nt11.53□□□□□ -0.56
EFM4P40516 GPI16YHR188C 1833 nt11.53□□□□□ -0.56
EFM4P40516 AGP1YCL025C 1902 nt11.52□□□□□ -0.56
EFM4P40516 MIC12YBR262C 321 nt11.52□□□□□ -0.57
EFM4P40516 AHT1YHR093W 549 nt11.5□□□□□ -0.57
EFM4P40516 CCT4YDL143W 1587 nt11.5□□□□□ -0.57
EFM4P40516 YIR016WYIR016W 798 nt11.49□□□□□ -0.57
EFM4P40516 ALG3YBL082C 1377 nt11.49□□□□□ -0.57
EFM4P40516 HHO1YPL127C 777 nt11.45□□□□□ -0.58
EFM4P40516 YPR064WYPR064W 420 nt11.44□□□□□ -0.58
EFM4P40516 DUS1YML080W 1272 nt11.43□□□□□ -0.58
EFM4P40516 SWC5YBR231C 912 nt11.43□□□□□ -0.58
EFM4P40516 PRP4YPR178W 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
EFM4P40516 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.39□□□□□ -0.59
EFM4P40516 YEL076CYEL076C 651 nt11.39□□□□□ -0.59
EFM4P40516 YLR464WYLR464W 651 nt11.39□□□□□ -0.59
EFM4P40516 RTG1YOL067C 534 nt11.38□□□□□ -0.59
EFM4P40516 TAD3YLR316C 969 nt11.37□□□□□ -0.59
EFM4P40516 DPS1YLL018C 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
EFM4P40516 DUT1YBR252W 444 nt11.36□□□□□ -0.59
EFM4P40516 ALG12YNR030W 1656 nt11.36□□□□□ -0.59
EFM4P40516 YKR005CYKR005C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
EFM4P40516 XDJ1YLR090W 1380 nt11.33□□□□□ -0.6
EFM4P40516 YCL074WYCL074W 927 nt11.33□□□□□ -0.6
EFM4P40516 UME6YDR207C 2511 nt11.31□□□□□ -0.6
EFM4P40516 YGR201CYGR201C 678 nt11.3□□□□□ -0.6
EFM4P40516 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
EFM4P40516 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
EFM4P40516 AAC1YMR056C 930 nt11.28□□□□□ -0.6
EFM4P40516 BDH1YAL060W 1149 nt11.26□□□□□ -0.61
EFM4P40516 YGR259CYGR259C 441 nt11.24□□□□□ -0.61
EFM4P40516 BMT6YLR063W 1098 nt11.24□□□□□ -0.61
EFM4P40516 AVT6YER119C 1347 nt11.24□□□□□ -0.61
EFM4P40516 STR3YGL184C 1398 nt11.24□□□□□ -0.61
EFM4P40516 SNF1YDR477W 1902 nt11.23□□□□□ -0.61
EFM4P40516 GDH3YAL062W 1374 nt11.23□□□□□ -0.61
EFM4P40516 MCH5YOR306C 1566 nt11.22□□□□□ -0.61
EFM4P40516 YLR415CYLR415C 339 nt11.2□□□□□ -0.62
EFM4P40516 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.19□□□□□ -0.62
EFM4P40516 AQY2YLL052C 450 nt11.19□□□□□ -0.62
EFM4P40516 GOR1YNL274C 1053 nt11.19□□□□□ -0.62
EFM4P40516 BIO5YNR056C 1686 nt11.17□□□□□ -0.62
EFM4P40516 SHM2YLR058C 1410 nt11.17□□□□□ -0.62
EFM4P40516 HUA1YGR268C 597 nt11.13□□□□□ -0.63
EFM4P40516 YSP3YOR003W 1437 nt11.12□□□□□ -0.63
EFM4P40516 NAR1YNL240C 1476 nt11.1□□□□□ -0.63
EFM4P40516 IRC24YIR036C 792 nt11.08□□□□□ -0.64
EFM4P40516 TIM17YJL143W 477 nt11.08□□□□□ -0.64
EFM4P40516 NIT1YIL164C 600 nt11.05□□□□□ -0.64
EFM4P40516 YNL115CYNL115C 1935 nt11.03□□□□□ -0.64
EFM4P40516 SGT2YOR007C 1041 nt11□□□□□ -0.65
EFM4P40516 RTN2YDL204W 1182 nt10.99□□□□□ -0.65
EFM4P40516 PBP1YGR178C 2169 nt10.99□□□□□ -0.65
EFM4P40516 YFL066CYFL066C 1179 nt10.98□□□□□ -0.65
EFM4P40516 DAT1YML113W 747 nt10.97□□□□□ -0.65
EFM4P40516 MRPL8YJL063C 717 nt10.96□□□□□ -0.65
EFM4P40516 ADO1YJR105W 1023 nt10.95□□□□□ -0.66
EFM4P40516 PEX25YPL112C 1185 nt10.95□□□□□ -0.66
EFM4P40516 NBP35YGL091C 987 nt10.93□□□□□ -0.66
EFM4P40516 YCR102CYCR102C 1107 nt10.91□□□□□ -0.66
EFM4P40516 PLB1YMR008C 1995 nt10.9□□□□□ -0.66
EFM4P40516 CYT2YKL087C 675 nt10.9□□□□□ -0.66
EFM4P40516 YJL225CYJL225C 5277 nt10.85□□□□□ -0.67
EFM4P40516 VPS75YNL246W 795 nt10.84□□□□□ -0.67
EFM4P40516 PRE6YOL038W 765 nt10.83□□□□□ -0.68
EFM4P40516 ARP6YLR085C 1317 nt10.82□□□□□ -0.68
EFM4P40516 PRM5YIL117C 957 nt10.79□□□□□ -0.68
EFM4P40516 YFR018CYFR018C 1092 nt10.78□□□□□ -0.68
EFM4P40516 SHH4YLR164W 507 nt10.78□□□□□ -0.68
EFM4P40516 YAT1YAR035W 2064 nt10.76□□□□□ -0.69
EFM4P40516 HIF1YLL022C 1158 nt10.73□□□□□ -0.69
EFM4P40516 UTR1YJR049C 1593 nt10.73□□□□□ -0.69
EFM4P40516 PAU7YAR020C 168 nt10.72□□□□□ -0.69
EFM4P40516 TIR3YIL011W 810 nt10.71□□□□□ -0.69
EFM4P40516 PRO1YDR300C 1287 nt10.7□□□□□ -0.7
EFM4P40516 GAP1YKR039W 1809 nt10.69□□□□□ -0.7
EFM4P40516 ALD4YOR374W 1560 nt10.69□□□□□ -0.7
EFM4P40516 YDR010CYDR010C 333 nt10.67□□□□□ -0.7
EFM4P40516 SHB17YKR043C 816 nt10.66□□□□□ -0.7
EFM4P40516 LSC2YGR244C 1284 nt10.64□□□□□ -0.71
EFM4P40516 POM34YLR018C 900 nt10.64□□□□□ -0.71
EFM4P40516 SFA1YDL168W 1161 nt10.63□□□□□ -0.71
EFM4P40516 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.62□□□□□ -0.71
EFM4P40516 CMP2YML057W 1815 nt10.62□□□□□ -0.71
EFM4P40516 ATG15YCR068W 1563 nt10.6□□□□□ -0.71
EFM4P40516 MIR1YJR077C 936 nt10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.9 ms