Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Chd1P40201 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Chd1P40201 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Chd1P40201 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Chd1P40201 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Chd1P40201 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Chd1P40201 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Chd1P40201 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Chd1P40201 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Chd1P40201 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Chd1P40201 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Chd1P40201 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chd1P40201 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Chd1P40201 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Chd1P40201 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Chd1P40201 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Chd1P40201 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Chd1P40201 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Chd1P40201 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Chd1P40201 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Chd1P40201 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Chd1P40201 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Chd1P40201 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Chd1P40201 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Chd1P40201 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Chd1P40201 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Chd1P40201 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Chd1P40201 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
Chd1P40201 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Chd1P40201 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Chd1P40201 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Chd1P40201 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Chd1P40201 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Chd1P40201 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Chd1P40201 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Chd1P40201 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Chd1P40201 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chd1P40201 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Chd1P40201 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Chd1P40201 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Chd1P40201 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Chd1P40201 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Chd1P40201 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Chd1P40201 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Chd1P40201 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Chd1P40201 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Chd1P40201 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Chd1P40201 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Chd1P40201 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Chd1P40201 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42■■■■■ 4.31
Chd1P40201 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Chd1P40201 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Chd1P40201 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Chd1P40201 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Chd1P40201 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Chd1P40201 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Chd1P40201 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Chd1P40201 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Chd1P40201 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
Chd1P40201 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Chd1P40201 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Chd1P40201 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Chd1P40201 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Chd1P40201 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Chd1P40201 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Chd1P40201 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Chd1P40201 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Chd1P40201 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Chd1P40201 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Chd1P40201 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Chd1P40201 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Chd1P40201 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Chd1P40201 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Chd1P40201 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Chd1P40201 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Chd1P40201 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Chd1P40201 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Chd1P40201 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Chd1P40201 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Chd1P40201 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Chd1P40201 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Chd1P40201 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Chd1P40201 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Chd1P40201 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Chd1P40201 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Chd1P40201 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Chd1P40201 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Chd1P40201 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms