Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM3P40198 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM3P40198 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM3P40198 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM3P40198 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM3P40198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM3P40198 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CEACAM3P40198 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM3P40198 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM3P40198 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms