Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBRP36941 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBRP36941 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBRP36941 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBRP36941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBRP36941 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTBRP36941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBRP36941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBRP36941 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBRP36941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTBRP36941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBRP36941 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBRP36941 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTBRP36941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTBRP36941 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTBRP36941 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBRP36941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBRP36941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBRP36941 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBRP36941 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LTBRP36941 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LTBRP36941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LTBRP36941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
LTBRP36941 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LTBRP36941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LTBRP36941 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LTBRP36941 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBRP36941 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBRP36941 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBRP36941 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBRP36941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBRP36941 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBRP36941 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LTBRP36941 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBRP36941 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBRP36941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTBRP36941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBRP36941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTBRP36941 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBRP36941 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBRP36941 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBRP36941 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTBRP36941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTBRP36941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTBRP36941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LTBRP36941 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBRP36941 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBRP36941 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LTBRP36941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBRP36941 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBRP36941 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LTBRP36941 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBRP36941 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBRP36941 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBRP36941 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBRP36941 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBRP36941 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LTBRP36941 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBRP36941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBRP36941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBRP36941 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBRP36941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBRP36941 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LTBRP36941 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBRP36941 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBRP36941 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBRP36941 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBRP36941 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBRP36941 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBRP36941 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBRP36941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBRP36941 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBRP36941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBRP36941 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBRP36941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBRP36941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBRP36941 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBRP36941 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBRP36941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBRP36941 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBRP36941 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LTBRP36941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTBRP36941 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBRP36941 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBRP36941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBRP36941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTBRP36941 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTBRP36941 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTBRP36941 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBRP36941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBRP36941 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBRP36941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTBRP36941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTBRP36941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTBRP36941 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTBRP36941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTBRP36941 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTBRP36941 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LTBRP36941 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBRP36941 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms